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论文摘要

利用eIF4E分离纯化非编码RNA的新方法

The Study of eIF4E Resin in Purifying Noncoding RNAs

作者:李佳(四川大学生命科学学院);丁沐然(四川大学生命科学学院);吴传芳(四川大学生命科学学院)

Author:LI Jia(College of Life Sciences, Sichuan University);DING Mu-Ran(College of Life Sciences, Sichuan University);WU Chuan-Fang(College of Life Sciences, Sichuan University)

收稿日期:2015-04-20          年卷(期)页码:2016,53(4):914-918

期刊名称:四川大学学报: 自然科学版

Journal Name:Journal of Sichuan University (Natural Science Edition)

关键字:帽子结构 poly(A)尾 eIF4E oligo(dT) 非编码RNA

Key words:cap structure poly(A) tail eIF4E Oligo(dT) noncoding RNAs

基金项目:国家自然科学基金面上项目31371325

中文摘要

大规模的研究表明人类转录组中存在大量的非编码RNA,其数量远远多于之前的预期.很多非编码RNA都没有poly(A)尾.这表明oligo(dT)并不适合用来纯化非编码RNA,现研究还发现许多非编码RNA都具有帽子结构,eIF4E作为真核生物的帽结合蛋白可以特异性地识别并结合帽子结构,因而实现对非编码RNA的亲和纯化.本研究利用原核表达的eIF4E蛋白,亲和纯化纯化分离得到了具有帽子结构的RNA.对比用其oligo(dT)分离的非编码RNA,eIF4E法得到了更多的非编码RNA.本研究为非编码RNA的分离与发现提供了一个重要的工具.

英文摘要

Recent large-scale studies of the human transcriptome suggest that there are much more abundant noncoding transcripts than previously excepted. Many noncoding RNAs in cells lack a canonical poly(A) tail, which suggests that Oligo(dT) resin is not appropriate to be used to enrich noncoding RNAs. eIF4E is a eukaryotic translation initiation factor involved in directing ribosomes to the cap structure of RNAs, included noncoding RNAs. Here we show that using eIF4E resin which expressed in prokaryote could enrich noncoding RNAs in the RNA isolation and obtain a much better result than that of Oligo(dT). The eIF4E protein provides an important tool to isolate and find noncoding RNAs effectively.

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